洪通作品畫面透露靈性、畫面流露出強烈精神力量、筆觸濃密、紋理纖細、形式繁瑣、無師自通的繪畫技巧。用色彩顏料，取材自然物，自行研磨混合，自製而成。材質以底材為主，分甘蔗板、紙、畫布三種。據知洪通創作畫作時除了以慣用手的右手為主外，有時會以左手、雙腳、生殖器具等身體部位輔以作畫。 洪通畫作元素多以人物、花鳥、樹木、船舶、飛機為主題，創作風格充滿童趣的風味，甚至有時一些宗教陣頭、廟宇建築、布袋戲、歌仔戲等日常生活表現及民間諺語、籤詩更是他繪畫拼湊結構組成的來源。洪通繪畫技巧用色多變且鮮明，不拘泥實體比例，創作風格超脫現實且自由，極具想像能力；畫作樸拙簡單的圖像，但卻能呈現出均衡且對稱的藝術美感。
由於早年的洪通做過乩童，讓他的生星思維受到信仰影響，五十歲時他開始專心畫畫不工作，繪畫中的花草樹木與符號等，均受過去生活背景經驗影響，繪畫中充滿熱鬧、神幻、宗教信仰的意象。洪通早期畫作整體結構與道教畫相似，道教畫分多層，幾層「天」幾層「地」，整張繪滿符籙花樣，而洪通畫的分層結構代表他自我意識世界的秩序和事物各自的本位，所以洪通畫的是人、萬物與天地的關係，且因為不識字，所以他的自創圖像字與文字畫，充滿自我意識的圖像字，畫中的簽名更是一絕，洪通的洪字像哥倆好，有時除簽下洪通外，還畫出洪朱豆，簽出的圖樣各有不同。
專家認為英國畫家史考第·威爾遜（ScottieWilson）的密集線條畫中老是隱藏著一隻隻窺視的眼精，與洪通的玩偶面孔有異曲同工之妙，而玩偶式的而孔或人類的形像，是靈異畫家所熱愛的主題，英國女畫家吉兒有些畫中佈滿了玩偶的面孔，處理手法幾乎與洪通出於同一路線。洪通使用了原始裝飾藝術中常見的幾何紋樣。鋸齒形的線條，格子式的編織幾乎是他的基本的手法。而在豐富的色彩與形象之中，他善於使用圓形的統合力，成為現代、原始趣味一種巧妙的綜合。
洪通被認為是線條結構的天才。在他的素描中，具一種高度的秩序感，統合感，然而又有一種生命的活力。可欣賞他的線條圖的紋理與組的美，以及阿米巴自由形態的造型。他的天才證實了在美術的基本原則上所追究的，確實是人類心靈中先天存在的秩序。他所使用的艷麗的色彩雖然幾乎都可自民間色彩中找出源頭，但是他把這些色彩使用在抽像的模式上，無疑的出於他個人直感的創造。而他用色的手法，多彩多姿，除了承認他潛在的色感之外，同時也說明了色彩學的原則已在他心靈的掌握之中，隨意賦彩，都有令人激賞的效果。 線條與色彩兩者構成他的作品中最精彩的部份。所以他的最好的作品乃是線條畫賦彩的一類。其素描使用硬線條構成者，遠勝過表達毛筆感覺的構圖。
洪通的作品並沒有脫離任何一位素人畫家作品共有的原型，繁複及制式的技巧，呈現時間與勞力的堆積，其次，由於缺乏邏輯與形上學思考，作品本身多層重複，與民俗藝術間有強烈的類似性；最後，素人畫家在作品表現上的神祕造型及豐富色彩，基本上反應了畫家世界的完全自我性及生活性，而這種自我性及生活性的完成，恰巧基於素人畫家不具備任何知識，所必然導致的個人素樸認知。
